Uma variedade de lasers tem sido utilizada especificamente para tratar lesões cutâneas pigmentadas. Estes lasers são utilizados para remover o pigmento exógeno das tatuagens, bem como para tratar doenças da pele causadas pela melanina endógena. A melanina está localizada nos melanossomas, que são organelos com 0,5-1,0 mm de tamanho. No tratamento a laser de lesões pigmentadas, o melanossoma é a principal estrutura alvo da ação do laser. A melanina absorve a luz em comprimentos de onda que vão desde o ultravioleta até ao infravermelho próximo, pelo que existe uma grande variedade de lasers que podem ser utilizados para tratar a melanina. A escolha dos comprimentos de onda terapêuticos baseia-se, em parte, em evitar picos de absorção noutros grupos de pigmentos. Com base no tempo teórico de relaxamento térmico dos melanossomas, a largura de pulso ideal não é superior a 70-250 ns. Os lasers Q-switched são, por isso, ideais para atingir os melanossomas. Quando o limiar de energia para a fragmentação dos melanóforos é atingido, as células de pigmento morrem. O tratamento de tatuagens com lasers de impulsos curtos provoca a quebra das partículas de tinta, causando seletivamente a morte das células que contêm pigmento e a libertação do pigmento. Existem vários mecanismos postulados para a remoção das partículas de pigmento. Algumas partículas de tinta (pigmento) são removidas por formação de crostas epidérmicas, outras por drenagem linfática e outras ainda por refagocitose das células dérmicas. Esta é a razão pela qual alguns doentes não apresentam formação de crostas visíveis após o procedimento a laser, mas mesmo assim o problema de pigmentação desaparece efetivamente. São utilizados diferentes tipos de lasers para tratar diferentes problemas de pigmentação. O laser de rubi Q-switched pode atingir energias até quase 10J/cm2, emitindo uma luz vermelha profunda de 694nm que é bem absorvida pela melanina. Com uma largura de impulso de 20-40ns, este laser é eficaz no tratamento da maioria das cores de tatuagens, exceto tons brilhantes de vermelho, amarelo, etc. O laser de rubi Q-switched é particularmente eficaz no tratamento da melanose dérmica, como o nevo de Ota. A literatura também inclui muitos relatórios de tratamento bem sucedido de manchas solares e nevos semelhantes a sardas utilizando o laser de rubi. As manchas de café com leite e os nevus pigmentosos também respondem ao tratamento com laser de rubi Q-switched (em alternativa, os lasers de rubi de largura de pulso longa podem ser utilizados para tratar nevus, visando ninhos de melanócitos), mas as recidivas são comuns (os melanócitos dérmicos são deixados para trás quando o laser é utilizado para tratar um nevus pigmentoso). O tratamento dos nevos pigmentados adquiridos é controverso e não existe uma avaliação histológica disponível, mas os resultados clínicos são bastante bons. O laser de pedra preciosa verde-esmeralda violeta Q-switched emite uma luz vermelha profunda a 755 nm com uma largura de impulso de 50-100 ns, e a sua gama de aplicabilidade é quase idêntica à do laser de rubi Q-switched. Os lasers Nd:YAG com Q-switched emitem energia na gama de comprimentos de onda do infravermelho próximo de 1064 nm, com uma largura de impulso comum de 10 ns. São utilizados principalmente no tratamento da melanocitose dérmica, como o nevo de Ota, e na remoção do pigmento azul-preto de tatuagens. A energia da luz de 1064 nm pode ser passada através de um cristal de KTP e depois multiplicada em frequência para produzir luz verde visível de 532 nm. Este laser Nd:YAG com frequência duplicada pode remover eficazmente a melanina epidérmica, bem como as tintas de tatuagem vermelhas e amarelas, mas não as tatuagens verdes. As complicações que podem ocorrer aquando do tratamento com energias mais elevadas são a hipopigmentação ou hiperpigmentação e alterações temporárias da textura da pele.