Algumas mulheres também experimentam a cessação da menstruação durante períodos biológicos normais como a puberdade, amamentação e menopausa. Embora não haja início da menstruação, a ovulação pode ocorrer nos ovários de uma mulher, apenas de forma algo irregular. A ovulação também pode ocorrer sem período menstrual e pode levar à gravidez se não for utilizada contracepção. Durante a puberdade e a menopausa, os ovários da mulher ovulam irregularmente porque o seu sistema endócrino está frequentemente desregulado e não produzem hormonas sexuais suficientes e ainda não são capazes de as segregar regularmente; durante a amamentação, a menstruação normalmente também pára. Os ovários também sofrem ovulação irregular como resultado da destilação ovariana de estrogénio e progesterona, que actuam sobre o endométrio, embora não provoquem a menstruação. Ocorre quando a quantidade de estrogénio e progesterona produzida não é suficiente para atingir a espessura do endométrio. Também quando as mulheres sofrem de doenças endócrinas como o hipotiroidismo e o hipertiroidismo, bem como doenças como as aderências uterinas, também pode ocorrer a menopausa e a ovulação, excepto que os ovários não ovulam como normalmente fazem todos os meses durante um ciclo menstrual normal. Assim, quando uma mulher tem relações sexuais apesar de estar em amenorreia, se tiver reacções precoces de gravidez, tais como náuseas e vómitos, também precisa de ir ao hospital para uma ecografia ginecológica e outros testes para ter excluído a ocorrência de gravidez.