Alguns casos de azoospermia causada por obstrução dos canais deferentes podem ser curados através de tratamento cirúrgico, mas nem todos, de acordo com a consideração global do estado e da situação cirúrgica. Atualmente, o principal tratamento da azoospermia obstrutiva consiste em levantar a obstrução através da anastomose epididimária microscópica do canal deferente, que tem uma taxa de recanalização mais elevada, um tempo de operação mais curto e menos complicações pós-operatórias, mas os requisitos para o operador são mais elevados. Se o bloqueio for causado pelo estreitamento do segmento intestinal do canal deferente ou do segmento pélvico do canal deferente, é muito difícil de curar, sendo recomendada a tecnologia de reprodução assistida para atingir o objetivo da procriação. É aconselhável ser orientado por um médico profissional quanto ao tipo de tratamento a utilizar e quanto à possibilidade de cura.