Os cistos aracnóides de fissura lateral são mais frequentemente encontrados em bebés e crianças e são frequentemente detectados acidentalmente durante uma TAC craniana após um traumatismo craniano, ou quando o cisto aracnóide causa um aumento da pressão intracraniana seguido de um abaulamento craniano localizado. Os cistos aracnoides de fissura lateral são na sua maioria congénitos e podem ocasionalmente ser encontrados no feto, com o cisto a aumentar gradualmente de tamanho após o nascimento, fazendo com que o lobo temporal se torne comprimido e atrofiado. Uma vez atingido um certo tamanho, o cisto pode comprimir o lobo frontal para cima e para a frente, contactar a dura-máter para fora e comprimir o osso temporal para se expandir para fora, e continuar a comprimir o lobo temporal para trás, causando mais atrofia. Cistos aracnóides enormes podem perder gradualmente o seu mecanismo de amortecimento da pressão intracraniana e podem mesmo causar um aumento lento da pressão intracraniana. Com o tempo, o tecido cerebral comprimido pode formar focos de epilepsia, seguidos de convulsões. Os quistos aracnoides de fissuras laterais devem ser vistos no hospital assim que forem detectados. Se o quisto for grande e estiver a comprimir o tecido cerebral, ou tiver mesmo causado abaulamento craniano localizado, deve ser tratado o mais cedo possível. O tratamento mais avançado é a fístula endoscópica do cisto, na qual se faz um buraco na região temporal e se corta a camada suja do cisto endoscopicamente, permitindo ao cisto comunicar com a piscina basal, onde o líquido do cisto pode entrar e participar na circulação do líquido cefalorraquidiano, o que por sua vez permite que a pressão do cisto caia e o tecido cerebral atrofiado recupere gradualmente.