O prognóstico da miocardite depende da sua etiologia, apresentação clínica e tipo histológico. Cerca de 50 por cento dos doentes com miocardite aguda recuperam num prazo de duas a quatro semanas. Os doentes com miocardite aguda têm sintomas atípicos, perturbações hemodinâmicas menos graves e maior variabilidade no grau de inflamação do miocárdio. Normalmente, 50% dos doentes recuperam num prazo de 2 a 4 semanas. No entanto, cerca de 25% dos casos desenvolvem disfunção cardíaca persistente e 12% a 25% dos casos deterioram-se acentuadamente ou morrem ou evoluem para doentes com cardiomiopatia dilatada avançada que requerem transplante cardíaco. Os doentes são aconselhados a procurar assistência médica imediata para sintomas como dispneia, palpitações e síncope inexplicável, e uma intervenção médica precoce pode melhorar efetivamente o prognóstico do doente.