As principais manifestações clínicas da síndrome dos anticorpos antifosfolípidos são trombose, aborto espontâneo habitual e trombocitopenia, que podem estar presentes em uma ou mais destas manifestações no mesmo paciente. O quadro clínico depende do tipo, localização e tamanho dos vasos envolvidos, e pode apresentar-se como uma única ou múltipla acumulação de vasos. A trombose venosa é mais comum que a trombose arterial, sendo a trombose venosa mais comum nas veias profundas dos membros inferiores, mas também nos rins, fígado e retina, sendo a trombose arterial mais comum no cérebro e nos membros superiores. A cianose reticular é também a manifestação mais comum da síndrome dos anticorpos antifosfolípidos e é vista como cianose reticular nos braços e pernas em aproximadamente 80% dos doentes.