Existem 138 subtipos conhecidos de HPV, com 40 tipos que causam infecções epiteliais do tracto genital. Existem dois tipos de HPV de acordo com a sua carcinogenicidade: 1. HPV de baixo risco (não relacionado com cancro, LRHPV): HPV 6, 11, 42, 43, etc. Acredita-se geralmente que este tipo de infecção por HPV não induz o desenvolvimento do cancro do colo do útero. 2. HPV16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59; HPV66, 70, 53, 67, 83 e AE5 são também reportados como tipos associados ao cancro. Destes, HPV16 e HPV18 são os mais comuns. são geralmente considerados como estando estreitamente associados ao desenvolvimento do cancro do colo do útero.