Se houver suspeita de queda irregular do endométrio, é realizada uma biópsia endometrial no 5º a 6º dia após a menstruação e o diagnóstico é feito se ainda se puder ver um endométrio que responda ao secretor no meio do útero. Isto porque o endométrio secreto é completamente eliminado no 3º ao 4º dia da menstruação normal. Os doentes com esta condição apresentam frequentemente um endométrio misto, ou seja, uma mistura de endométrio secreto residual com tecido necrótico hemorrágico e novos crescimentos.
Algumas áreas do endométrio ainda estão a sangrar e este é o momento certo para fazer uma biopsia, pelo que deve ser feita 5-6 dias após o início da menstruação para um melhor julgamento da exactidão do diagnóstico da doença.