O curso da pneumonia infecciosa neonatal é de cerca de 5-15 dias, mas a pneumonia neonatal grave pode durar mais de 20 dias ou mesmo um mês. A função imunitária do recém-nascido não está bem desenvolvida e predispõe o recém-nascido à infecção por bactérias patogénicas, que podem causar pneumonia. Se a pneumonia for causada apenas por uma infecção bacteriana, o bebé pode ter alta do hospital em cerca de 5-10 dias. No entanto, se a pneumonia for causada por micoplasma ou infecções virais ou mesmo outras complicações graves, pode levar mais de 2 semanas a sarar e o bebé pode mesmo precisar de ventilação assistida por ventilador para evitar a morte por asfixia. Além disso, outros tratamentos de apoio durante o tratamento também são importantes, incluindo a estabilização da temperatura, equilíbrio de fluidos e medicação. Além disso, podem ser utilizados métodos físicos para ajudar a arrefecer o recém-nascido durante o tratamento da pneumonia, e os pais precisam de alimentar os seus filhos com muitos líquidos para evitar a desidratação. A alimentação deve ser ligeiramente reduzida para minimizar a carga sobre o tracto gastrointestinal, e o bebé deve ser mantido quente após a alta para evitar ficar frio.