Pequenos inchaços no pénis podem ser causados por falta de higiene pessoal ou práticas sexuais inseguras (por exemplo, ter múltiplos parceiros ao mesmo tempo, não usar preservativos durante o sexo, etc.) e infecções tais como infecções fúngicas, vírus do papiloma humano ou vírus infeccioso do molusco contagioso.
Pequenos inchaços no pénis podem também resultar de fricção frequente, irritação por factores adversos ou o uso de medicamentos que causam alergias.