As fezes aquosas são o resultado de enterite aguda, infecção por rotavírus e disenteria. Durante um ataque de enterite aguda, há uma diarreia violenta devido à presença de inflamação na mucosa intestinal e, por conseguinte, função prejudicada e hiperperistalia. Quando o conteúdo do intestino do paciente tiver sido completamente expelido, o fluido que escorre do intestino é expelido do corpo, uma vez que já não há resíduos alimentares presentes, e as fezes tornam-se então predominantemente aguadas. Quando o rotavírus infecta o tracto intestinal, pode também causar diarreia grave. Nas fases iniciais, o paciente excretará resíduos alimentares, mas quando os resíduos alimentares tiverem sido removidos, as fezes ficarão aguadas. A disenteria é uma doença causada por infecções bacterianas e caracteriza-se por inchaço, diarreia e febre. Se a disenteria não for tratada rapidamente, não só a mucosa intestinal é danificada, mas também a água não é absorvida pelo corpo e os intestinos secretam uma grande quantidade de água, que é excretada com peristaltismo intestinal, pelo que as fezes são aquosas.