Com o desenvolvimento da tecnologia médica, cada vez mais medicamentos estão disponíveis para tratar a conjuntivite alérgica, mas o que realmente revolucionou o tratamento é a descoberta da patogénese da conjuntivite alérgica, que é uma reacção metamórfica causada pela exposição a alergénios, pelo que a anti-alergia é o principal tratamento. Devido à variedade de sintomas da conjuntivite alérgica, a escolha do medicamento varia, pelo que é necessário tomar uma história e sintomas detalhados antes de se poder desenvolver um plano de tratamento completo para alcançar bons resultados. A abordagem geral do tratamento é, em primeiro lugar, eliminar o alergénio (evitar activamente o contacto ou proteger-se dos alergénios) e, em segundo lugar, dar medicação detalhada, incluindo a terapia anti-histamínica (gotas de imodium), estabilizadores de mastócitos (gotas cromoglicos de sódio), anti-inflamatórios não esteróides (aspirina), vasoconstritores (oxymetazoline) e glicocorticóides (dexametasona). Devido à existência de tantos medicamentos, é difícil para os não-especialistas estarem familiarizados com os princípios envolvidos, e a variabilidade de cada indivíduo torna ainda mais difícil controlar o uso de medicamentos, pelo que não deve comprar os seus próprios medicamentos para usar. Em resumo, a medicação para conjuntivite alérgica precisa de ser administrada por um especialista, de acordo com as circunstâncias específicas do paciente, e o paciente deve cooperar activamente com o tratamento a fim de resolver a doença o mais rapidamente possível.