Uma dose completa e o curso do tratamento é um princípio importante no tratamento desta doença, matando completamente as bactérias e reduzindo a resistência bacteriana, lembrando-se de não parar a medicação sem autorização.
Em geral, a medicação deve ser administrada durante pelo menos 2-3 semanas em doentes sem complicações, durante pelo menos 4-6 semanas em doentes que desenvolvem lesões do tipo abcesso torácico ou cavitário, e durante 6 semanas ou mais em doentes que desenvolvem endocardite.