O prolapso anal pode ser causado por obstipação prolongada, diarreia, aumento da próstata, dificuldade em urinar, tosse crónica, etc., o que causa um aumento contínuo da pressão abdominal e empurra para baixo no recto. Também pode ser causado por hemorróidas, pólipos rectos, pólipos colónicos, tumores no canal anal e papilas anais aumentadas.