A ectopia sebácea do pénis é uma variante fisiológica normal e não requer tratamento em circunstâncias normais. No entanto, pode aparecer como um milho do tamanho de um arroz, e não requer tratamento se não houver um desconforto particular. Se a glândula ectópica sebácea for secundária a um cisto sebáceo ou se houver uma infecção bacteriana formando um abcesso, é necessário um tratamento local anti-inflamatório e sintomático. Bactrim, ou pomada de eritromicina pode normalmente ser aplicada. A incidência aumenta se o paciente tiver diabetes, principalmente devido à neuropatia periférica causada pela diabetes e a uma diminuição da imunidade da membrana mucosa da pele contra bactérias. No caso da simples ectopia sebácea do pénis, existem apenas alterações cosméticas. Não afecta a função fisiológica normal ou a vida quotidiana do corpo, nem afecta a função sexual masculina ou o metabolismo normal da pele ou da transpiração. Portanto, não é necessário nenhum tratamento específico para a ectopia sebácea do pénis.