A amoxicilina ainda é eficaz no tratamento da otite média, mas é importante utilizar a medicação especificamente para cada caso. Amoxicilina, como antibiótico, é eficaz tanto em meios de otites secretas como em meios de otites supurativas. No entanto, para a otite média secretora, por cima da amoxicilina oral, recomenda-se a toma de alguns medicamentos orais que promovem a absorção de líquidos e o desaparecimento de edemas mucosos, tais como os softgels entéricos de erva-limão de eucalipto. No caso de otite média purulenta, são recomendadas gotas auriculares de oxyfluoxacina tópica em cima de amoxicilina oral. Se a amoxicilina for aplicada há muito tempo, pode ser apropriado substituí-la pelo clavulanato de amoxicilina oral relativamente mais eficaz, que pode ser mais eficaz em comparação com a amoxicilina.