A duração da hospitalização para a pneumonia neonatal é geralmente de cerca de 1-2 semanas, uma vez que o sistema imunitário não está bem desenvolvido e o neonato é susceptível a infecções patogénicas tais como vírus respiratório sincítico ou Streptococcus pneumoniae. Neste caso, o recém-nascido deve receber medicação antibacteriana para combater a infecção e terapia inalatória nebulizada para aliviar a tosse e a expectoração. A maioria dos sintomas da pneumonia irá melhorar gradualmente após o tratamento anti-infeccioso e da expectoração, mas como a inflamação não desaparece em 1-2 dias, há um processo de doença e a maioria dos recém-nascidos irá recuperar da pneumonia após cerca de 1-2 semanas de medicação.