A protrusão escapular em crianças é geralmente causada por certas doenças genéticas, tais como a síndrome de Marfan e a síndrome de Parsonage-Turner (neurite aguda do plexo braquial). Existem também doenças congénitas, tais como hipertelorismo congénito e escoliose congénita, que podem levar ao desenvolvimento ósseo anormal, resultando em protrusão escapular.