O conjunto completo de proteínas feitas por um organismo. As proteínas são feitas em diferentes quantidades e em diferentes momentos, dependendo de como funcionam, quando são necessárias, e como interagem com outras proteínas dentro das células. A informação sobre um proteoma pode ser utilizada para ajudar a descobrir quais as proteínas envolvidas em doenças, tais como o cancro. Também pode ser utilizada para ajudar a desenvolver medicamentos que bloqueiam estas proteínas.