A técnica de PCR é altamente específica e sensível e tem sido amplamente utilizada no campo médico, bem como em exames dermatológicos, sendo actualmente considerada como o melhor método para a detecção e digitação de HPVDNA. -A técnica PCR é utilizada para detectar HPVDNA em lesões frescas, secreções ou amostras de muco, não só para a detecção clínica de diferentes doenças causadas por HPV e para investigar a prevalência da infecção por HPV em diferentes populações ou indivíduos, mas também para o estudo dos mecanismos patogénicos e cancerígenos do HPV. O HPV-DNA tem uma taxa de positividade muito mais elevada do que outros testes e é a ferramenta mais usada para o diagnóstico do HPV (tipos 6/11) em condiloma e HPV (tipos 16/18) em associação com o cancro do colo do útero.