É possível utilizar medicamentos para infecções vaginais durante a amamentação, uma vez que a amamentação pode causar efeitos adversos no bebé, uma vez que muitos medicamentos podem ser absorvidos no leite do bebé. O uso de medicamentos durante a amamentação é prudente e deve ser supervisionado por um médico. São utilizados tampões locais e loções tópicas para tratar infecções vaginais durante a amamentação, ambos com um efeito mínimo sobre o bebé. Se a infecção for causada por vaginite bacteriana, podem ser usados supositórios de metronidazol. Ambos podem ser usados para lavar a vulva com água, ou usar loção Bacitracin ou loção Red Nucleus.