Os bebés têm funções fracas do baço e do estômago e sofrem frequentemente de vómitos e diarreia devido à alimentação e a outras razões. A causa mais comum é a gastroenterite. As suas manifestações clínicas típicas são diarreia, náuseas, vómitos e dor abdominal. A infeção viral é a causa mais frequente de gastroenterite. Vários vírus podem causar gastroenterite, sendo o mais comum o rotavírus, seguido do norovírus, do astrovírus e do adenovírus entérico. A coisa mais importante no tratamento da gastroenterite em bebés é repor a água e os electrólitos. É suficiente que a criança fique em repouso na cama e beba uma quantidade suficiente de água (por exemplo, solução de sais de reidratação oral), e mesmo os doentes que estão a vomitar devem tentar beber tanta água quanto possível. As bebidas gaseificadas, o chá, as bebidas desportivas, as bebidas com cafeína e os sumos de fruta não são adequados para a reidratação. A reidratação intravenosa é necessária se a criança tiver vómitos ou diarreia prolongados ou se houver desidratação grave. Podem ser adicionados antieméticos se os vómitos forem graves ou se a diarreia durar mais de 24 a 48 horas e não houver sinais de uma infeção bacteriana mais grave. Os antieméticos e os medicamentos antidiarreicos não são geralmente recomendados para crianças. Como os antibióticos podem causar diarreia ou promover o crescimento de bactérias resistentes aos medicamentos, os antibióticos não são normalmente recomendados, mesmo que o organismo causador da gastroenterite tenha sido identificado. No entanto, os antibióticos podem ser utilizados para determinadas infecções por bactérias patogénicas (por exemplo, Campylobacter, Shigella, Vibrio cholerae, etc.) ou se o doente tiver diarreia do viajante. Os antibióticos não são eficazes para a gastroenterite causada por infecções virais. A gastroenterite causada por uma infeção parasitária requer medicamentos antiparasitários. A gastroenterite nas crianças desenvolve-se rapidamente e as perturbações electrolíticas são um problema muito perigoso. A autoadministração de medicamentos antieméticos e antidiarreicos não é geralmente recomendada nas fases iniciais.