Os principais agentes patogénicos que causam bronquite em bebés incluem bactérias, vírus, micoplasma e clamídia, pelo que é essencial escolher um tratamento direccionado. As infecções bacterianas em crianças com bronquite podem ser controladas por cefalosporinas, se forem causadas por infecções virais pode escolher medicamentos antivirais, os bebés com bronquite causada por micoplasma e clamídia podem escolher antibióticos macrolídeos como a azitromicina para controlar a infecção, só escolhendo um tratamento específico é que a bronquite do seu bebé terá um bom resultado.