As fezes aquáticas em recém-nascidos são geralmente causadas por um abdómen frio ou por uma dieta pobre. A primeira coisa a fazer é manter o abdómen do recém-nascido quente e observar os movimentos intestinais. Se as fezes aquosas persistirem, é aconselhável ir ao hospital e usar medicamentos sob a orientação do médico para evitar desidratação ou outras complicações no recém-nascido. São necessários testes às fezes para identificar a causa específica do problema e depois administrar a medicação apropriada. As infecções bacterianas são frequentemente tratadas com antibióticos. Para infecções virais, podem ser utilizadas preparações microecológicas, tais como comprimidos de Lactobacillus e comprimidos de Bifidobacterium trisporus. No entanto, a utilização dos medicamentos acima mencionados precisa de ser estritamente regulada de acordo com o estado do recém-nascido e, portanto, precisa de ser utilizada sob a orientação de um médico. Durante a alimentação dos recém-nascidos, é importante prestar atenção à quantidade de alimentos e à higiene durante a alimentação, tais como a temperatura da água e a esterilização dos biberões, para evitar a acumulação de alimentos e infecções bacterianas que podem levar a desconforto gastrointestinal. É também importante manter a temperatura ambiente adequada e vestir o recém-nascido com roupa apropriada para evitar um abdómen frio. É também importante manter o recém-nascido hidratado para evitar a perda de líquidos que possam levar à desidratação. Os pais devem também prestar atenção às fezes do recém-nascido, que são muitas vezes um indicador directo do estado do bebé. As mães que amamentam devem também prestar atenção à sua dieta, evitando alimentos picantes e estimulantes ou alimentos demasiado frios.