A congestão nasal alternada não necessita geralmente de receber tratamento cirúrgico, o tratamento clínico é principalmente através de medicação para aliviar os sintomas clínicos dos pacientes. Se o paciente tiver uma congestão nasal grave, os descongestionantes e anti-histamínicos podem ser utilizados conforme prescrito pelo médico. Se estiverem presentes dores de cabeça, febre, dores musculares e dores, podem ser utilizados anti-inflamatórios não esteróides. Se as secreções das vias aéreas forem aumentadas, podem ser utilizados medicamentos expectorantes.