A taxa de sucesso da FIV com endometriose é reduzida em comparação com as pessoas que não sofrem desta doença. A FIV é uma forma de assistência à gravidez através do transplante de um óvulo fertilizado diretamente para o útero da mulher. A endometriose tende a invadir os ovários, levando à infertilidade, principalmente relacionada com a proliferação anormal das células endometriais, o que leva a aderências em torno das trompas de Falópio, ou faz com que os ovários funcionem de tal forma que torna a paciente infértil. A endometriose afecta todo o ambiente pélvico e a taxa de sucesso da fertilização in vitro é reduzida em comparação com as pessoas sem endometriose. Especialmente nos estádios 3 ou 4 da endometriose, a taxa de sucesso é ainda mais baixa. Recomenda-se que as doentes com endometriose sejam tratadas ativamente para as ajudar a conceber o mais rapidamente possível.