As garrafas precisam geralmente de ser esterilizadas por fervura a altas temperaturas após cada utilização para garantir a sua limpeza. Como os biberões são utilizados para alimentar bebés e crianças pequenas, se não forem devidamente limpos e esterilizados, podem facilmente causar indigestão e enterite. Se as garrafas não forem limpas após a sua utilização, o leite residual deteriorar-se-á em cerca de 2 horas. Por conseguinte, é importante limpar e esterilizar as garrafas imediatamente após a sua utilização, e depois guardá-las para evitar a contaminação e mantê-las prontas para utilização. As garrafas não utilizadas são também geralmente melhor desinfectadas uma vez por dia, quer fervendo a alta temperatura durante 10-15 minutos. Os pais são aconselhados a escolher garrafas de qualidade, uma vez que as garrafas de má qualidade podem libertar substâncias tóxicas quando esterilizadas por fervura a altas temperaturas, o que pode ser mais prejudicial para a saúde dos bebés e das crianças. Recomenda-se também mudar a garrafa uma vez em cerca de 3-6 meses.