As causas mais comuns de desbaste endometrial são desordens endócrinas, infecções e manipulação uterina. As perturbações endócrinas incluem baixos níveis de estrogénio, perturbações da ovulação e deficiência da hormona de crescimento; as infecções uterinas agudas ou crónicas podem levar à destruição da camada basal do endométrio, incluindo infecções bacterianas, tuberculose reprodutiva, infecções por micoplasma e infecções por clamídia.
As operações clínicas que afectam o endométrio, incluindo curetagem, miomectomia histeroscópica, remoção de pólipos endometriais e miomectomia laparoscópica que penetra na cavidade uterina, podem danificar o endométrio, resultando em filtrum endometrial e aderências uterinas.