As causas mais comuns de desbaste endometrial são desordens endócrinas, infecções e operações uterinas. As perturbações endócrinas incluem baixos níveis de estrogénio, perturbações da ovulação e deficiência da hormona de crescimento; as infecções uterinas agudas ou crónicas podem levar à destruição do revestimento basal do endométrio, incluindo infecções bacterianas, tuberculose reprodutiva, infecções por micoplasma e infecções por clamídia.
As operações clínicas que afectam o endométrio incluem curetagem, miomectomia histeroscópica, remoção de pólipos endometriais e miomectomia laparoscópica através da cavidade uterina, podendo todas elas danificar o endométrio e levar a afinamento endometrial e aderências da cavidade.