Os princípios de tratamento da vaginite bacteriana baseiam-se no uso de drogas anti-anaeróbias, principalmente metronidazol, tinidazol e clindamicina. O metronidazol inibe o crescimento de bactérias anaeróbias e não afecta o crescimento do Lactobacillus, que é a droga mais desejável. O método de dosagem é o seguinte: i. Medicação oral. Preferir metronidazol 400 mg por via oral duas vezes por dia durante 7 dias. ii. Válvulas vaginais. Pessário de Metronidazol contendo 200 mg, inserido uma vez por noite durante 7 dias, ou Pessário de Diazotide, inserido de dois em dois dias durante 4 vezes. Lavagem tópica com solução de iodophor. Se houver ataques recorrentes, pode usar um medicamento anti-anaeróbico diferente para o tratamento inicial, tal como metronidazol pela primeira vez, e tinidazol ou clindamicina para recorrência, ou uma preparação vaginal de lactobacillus para melhorar o ambiente vaginal ácido-base.